Farklı Karbon Kaynaklarının Neocallimastix sp.’nin Lignoselülolitik Enzim Üretim Miktarı Üzerine Etkileri


Yazdıç F. C., Ekinci K., Uzdil B., Kar B., Özköse E.

5.Avrasya Uluslararası Uygulamalı Bilimler Kongresi, Adana, Türkiye, 15 Kasım 2019 - 17 Şubat 2021, ss.457-462

  • Yayın Türü: Bildiri / Tam Metin Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Adana
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.457-462
  • Atatürk Üniversitesi Adresli: Hayır

Özet

ÖZET Anaerobik gut fungusları (AGF) temel olarak memeli herbivorların sindirim sisteminde yaşarlar ve konakçı hayvan ile simbiyotik bir ilişki içerisindedirler. Çiftlik hayvanlarından ruminantların rumen bölgesi temel yaşam alanlarını oluştururken, at ve eşek gibi tek midelilerin kalın bağırsağının ilk bölmesi olan sekum bu özel mikroorganizmaların konakladığı bölgedir. Konakçı hayvan uygun pH, uygun nem, uygun sıcaklık ve uygun besi ortamı sunarken bu mikroorganizmalar karşılığında hayvanlar tarafından sindirilmeleri oldukça sınırlı olan lignoselülozik yapıları monomerlerine kadar parçalarlar. Bu biyodegradasyon AGFlerin oldukça yüksek aktivitelere sahip olan fibrolitik polisakkaridazları sayesinde gerçekleşir. AGF suda çözünebilir ve çözünemeyen karbon kaynakları üzerinde büyüme sırasında farklı polisakkaritleri parçalayıcı enzimler üretirler ve bu enzimlerin aktiviteleri, biyokütle konsantrasyonları ile pozitif korelasyon gösterir. Çalışmada kullanılan anaerobik gut fungusu (AGF) Neocallimastix sp. (GMLF-24) izolatı Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Zootekni Bölümü, Biyoteknoloji ve Gen Mühendisliği Laboratuarı’nda bulunan Anaerobik Fungus Kültür Koleksiyonu’ndan temin edilmiştir. Morfolojik ve moleküler verilerin ışığı altında tanımlanmış olan Neocallimastix GMLF-24 izolatının farklı karbon kaynaklarındaki (mısır koçanı, culban (Vicia peregrina), yer elması, buğday samanı (Triticum aestivum), muz kabuğu, sellobiyoz ve karboksimetilselüloz) büyüme, gelişme ve genel biyokütle değişimleri takip edilmiştir. GMLF-24 izolatının farklı zamanlardaki (0., 3., 5. ve 7. günlerdeki) karboksimetil selülaz, aviselaz, amilaz ve ksilenaz enzim aktivitelerindeki olası farklılıklar DNS metodu ile araştırılmıştır. Farklı günlerde toplanan enzim örneklerinde DNS metodu ile belirlenmiş olan KMSaz aktivitesi 0,21±0,06 ile 3,12±0,40 U/ml aralığında gözlemlenirken GMLF-24 izolatının en yüksek KMSaz aktivitesinin mikroorganizma enerji kaynağı olarak sadece KMS içeren besi yerinde yetiştirildiğinde kaydedilmiştir. Aynı şekilde yapılan değerlendirmede Ksilenaz 1,44±0,72-13,24±0,75 U/ml aralığında enerji kaynağı olarak buğday samanında, amilaz 1,27±0,64-7,34±0,93 U/ml aralığında yerelmasında ve aviselaz ise 0,66±0,44-2,96±0,23 U/ml aralığında enerji kaynağı olarak culban içeren besi yerinde belirlenmiştir. Bu değerler literatürde yer alan anaerobik gut funguslarının fibrolitik enzim üretim değerleri ile karşılaştırmalı olarak tartışılmış ve biyoteknolojik ve tarımsal uygulamalar için olası kullanım alanları önerilmiştir. Anahtar Kelimeler: Amilaz, aviselaz, karboksimetilselülaz ve ksilenaz, Neocallimastix sp 

ABSTRACT Anaerobic gut fungi (AGF) inhabits in the gastro intestinal tracts of mammalian herbivores and they have a symbiotic relationship with the host animals. For ruminant farm animals, these microorganisms live in the foregut of the digestive system although their main function area is caecum of single stomached animals such as horse and donkey. The host animal supply a suitable pH, optimum humidity and temperature, and a perfect nutritive environment for AGF, these microorganisms, in return, degrade the lignocellulolytic plant biomass into their soluble monomers which are readily consumed by the hosts. This biodegradation is occurred with the aid of highly active and wide-array lignocellulolytic enzymes produced by AGF when they were grown on the medium containing either soluble or insoluble carbon sources. The AGF (Neocallimastix sp GMLF24) used in current study was obtained from the fungal culture collection of KSU, Biotechnology and Gene Engineering Laboratory. This isolate was grown on the medium containing either of corncob, broad-pod vetch (Vivia peregrina), sunroot, wheat straw (Triticum aestivum), banana peel, cellobiose and carboxy methyl cellulose (CMC). The possible effects of these carbon sources on the CMCase, avicelase, amylase and xylanase enzyme activities of the isolate GMLF 24 were determined by DNS method for 0, 3, 5, and 7 days incubation time. CMCase activity were determined between 0,21±0,06 and 3,12±0,40 U/ml, whilst, the maximum activity was observed when the isolate GMLF24 was grown on the medium including CMC as sole energy source. Xylanase activity of the isolate was recorded between 1,44±0,72 and 13,24±0,75 U/ml when it was grown in the wheat straw containing medium and these figures were found as between 1,27±0,64 and 7,34±0,93 U/ml P. 439 2 for amylase when it was grown in sunroot containing medium and between 0,66±0,44 and 2,96±0,23 U/ml for avicelase when it was grown in broad-pod vetch containing medium as sole energy source. Keywords: Amylase, Avicelase, CMCase, Neocallimastix sp., Xylanase