Bacterıorhodopsın'in üretim proseslerinin optimizasyonu ve nanobiyomateryal kullanımında farklı alttaşlara immobilizasyonu


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Nanobilim Ve Nanomühendislik Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: NESLİHAN HIDIROĞLU İSPİRLİ

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Medine Güllüce

Özet:

Bu çalışmanın temel amacı; Tuz Gölü'nden alınan halofilik Arke türlerince sentezlenen ve ekonomik olarak oldukça değerli bir materyal olan bacteriorhodopsinin teknolojik çalışmalarda kullanım verimini arttırarak bir katma değer haline getirmek hedeflenmektedir. Yöntem: Bu çalışma bacteriorhodopsin (bR) sentezleyici halofilik Arke türlerinin Tuz Gölü'nden alınan karışık kültür örneklerinden izolasyonu ve kültür şartlarının optimize edilmesine dayalıdır. İki aşamadan oluşan çalışmanın ilk adımı; bacteriorhodopsinin üretim süreçlerinin optimizasyonu, ikinci adım ise; saflaştırılmış bR'nin farklı alttaşlara immobilizasyonundan oluşmaktadır. Bulgular: Halofilik Arke örneklerinden kültürlerin izolasyonu sağlanarak 11 adet bR sentezleyebilen saf izolat elde edilmiştir. Kültür ve bR üretim optimizasyon işlemleri Halobacterium salinarum olduğu saptanan NES5 suşu üzerinden gerçekleştirilmiştir. Kültürlerden saflaştırılan bR örnekleri, elektroforetik sedimantasyon ve damlatma-kurutma teknikleriyle alttaşlar üzerine immobilize edilmiştir. Immobilizasyon sonucunda yapılan karakterizasyon işlemleri ile ince filmlerin yapısı incelenmiştir. Sonuç: Yapısal dayanıklılık, eşsiz fotokromizm ve stabilitesi sayesinde teknolojik çalışmalarda kullanılabilecek biyomateryaller arasında oldukça önemli bir yere sahip olan bR'nin biyolojik sentez ve izolasyon sürecindeki zorluklar dolayısıyla üretim optimizasyonu büyük önem taşımaktadır. Bu açıdan çalışmamızda gerçekleştirilen optimizasyon, immobilizasyon ve karakterizasyon işlemleri ile bR'nin teknolojik araçlarda kullanılabilir ürün haline getirilmesinde önemli bir gelişme kaydedilmiştir. Anahtar Kelimeler: Halobacterium salinarum, Bacteriorhodopsin, mor membran, proton pompası, protein saflaştırma, sıvı iki fazlı sistem, protein immobilizasyonu, elektroforetik sedimantasyon, drop-casting, SDS-Page, UV-Vis, XRD, XPS, SEM, TEM, Profilometre, Dönüşümlü voltametri