Akademik Veri Yönetim Sistemi
Orhan F. (Yürütücü), Bektaş M., Barış Ö., Erman Ö. K.
TÜBİTAK Projesi, 2020 - 2021
Canlılar
dünyasının tür çeşitliliği bakımından en zengin gruplarının başında gelen
böceklerin; beslenme, yaşam alanı ve farklı yaşam ortamlarına uyum bakımında büyük
bir çeşitlilik gösterir ve bu durum da organizmaların vücut florasından yeni
tür ve suşların izalosyon şansını artırmaktadır. Ayrıca böcek mikroflorasının
bilinmesi onların beslenme fizyolojisi, bağırsak ekosistemleri, çeşitli
mikrobiyal hücumlardan etkilenme veya onlara direnç gösterme mekanizmaları vb.
konuların aydınlatılması hususunda da önemli ipuçları vermektedir. ‘Sucul kınkanatlılar takımından bazı familyalara (Dytiscidae, Hydrophilidae
ve Helophoridae) ait böcek türlerinin sindirim yapılarında bakteri
mikrobiyotasının tespiti ve türler bazında karşılaştırılması’ başlıklı
çalışmamızda sucul kınkanatlılara ait böceklerde bağırsak
kültüre edilebilen bağırsak mikrobiyotasının tesbiti, fenotipik ve genotipik
yöntemlerle karekterizasyonu amaçlanmıştır.
Bu çalışma kapsamında Erzurum ve çevresindeki
farklı lokalitelerdeki sucul ortamlardan 25.05.2020-12.09.2020 tarihleri
arasında toplanan böcekler kullanılmıştır. Toplanan örneklerin tür teşhisi
yapıldıktan sonra sindirim kanalı laboratuvarda aseptik şartlar
altında disekte edilip ayrıştırılmış ve bekletilmeden mikrobiyolojik analizleri
yapılmıştır.
Mikroorganizmaların identifikasyonunda moleküler
yöntemlerin, konvansiyonel bir yöntem olan API 20E multi test sistemi ile desteklenmesi
amaçlanmıştır. Bu nedenle enterik
bakteri olduğu düşünülen 25 adet örnek seçilerek API 20E (biomerieux) testi ile
karakterizasyonunu yapılmıştır. Ardından API testi ile uyguladığımız izolatlara
ilave olarak farklı olduğunu düşündüğümüz örneklerden de seçilerek toplam 67 adet
izolat, PCR
reaksiyonu ile çoğaltılıp
16S rDNA genleri çoğaltılarak baz
dizi analizi belirlenmiştir. Elde edilen DNA dizileri
BLAST analizi sonrasında, izolatların moleküler ve konvansiyonel
verileri birlikte değerlendirilerek isimlendirilmiş ve GenBank kabul numaraları
alınmıştır. Çalışmamız sonucunda 140
adet bakteri izole
edilmiş olup bunlardan basit karakterizasyon yöntemleri ile farlı olabileceği
düşünülen 66’sı tür ya da cins düzeyinde tanımlanmıştır.