Akademik Veri Yönetim Sistemi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2017 - 2019
Enfeksiyonel hastalıklarda doğru tedavilerin zamanında uygulanabilmesi için hastalığa neden olan
patojen mikroorganizmaların erken ve doğru bir şekilde tanımlanması oldukça kritiktir. Günümüzde
mikrobiyal tanıda en yaygın olarak kullanılan yöntemler, koloni ve kültür temelli yöntemlerdir. Bu
yöntemlerde, hastalardan elde edilen kan, idrar, gayta, tükürük gibi biyolojik numunelerden izole edilen
mikroorganizmaların tekrarlı kültivasyon adımlarıyla genel tanımlamaları yapılır. Asıl tedavi adımı için
gerekli olan tür düzeyinde tanımlama içinse çeşitli immünolojik, mikrobiyolojik ve biyokimyasal test
tekniklerinin kullanılması gerekmektedir. Bu durumda, patojenin tespiti için geçen süre günleri hatta
haftaları bulabilmektedir ve patojenin kültive edilemediği durumlarda kültür ve koloni temelli yöntemler
yetersiz kalabilmektedir. Değişen fenotipik özellikler bu yöntemlerin spesifikliğini düşürmekte, daha
spesifik olduğu bilinen immünolojik yöntemlerde ise yüksek antikor veya antijen gereksiniminden
dolayı hassasiyet problemleri ile karşılaşılmaktadır (Agne et al., 2009; Siqueira and Rôças, 2005; Sousa
and Pereira, 2013)
Bu tez çalışmasında nazokomiyal (Hastane kaynaklı=HAI) enfeksiyonlarda sıklıkla karşılaşılan
bakteriyel ve fungal türlerin tespitinde kullanılacak, çoklu analize olanak sağlayan bir PCR temelli bir
tanı yöntemi geliştirilecektir. Geleneksel kültür ve koloni temelli yöntemlere kıyasla daha spesifik,
hassas, hızlı ve kesin olan bu yöntem sayesinde nazokomiyal enfeksiyonların tespitinde geleneksel
mikrobiyal tanı yöntemlerine alternatif ve onlardan daha etkin bir tanı yöntemi sunulacaktır. Dolayısıyla,
bu hastalıkların tedavisi için gereken süre ve maliyetlerin azaltılmasına, antimikrobiyal direnç gibi
yaygın problemlerin de minimuma indirilebilmesine katkı sağlanabilecektir. Bu çalışma ayrıca,
enfeksiyonel hastalıkların tespitinde kullanılmak üzere geliştirilebilecek PCR yöntemleri için kılavuz
niteliğinde bir çalışma olacaktır. Böylece, Nanopartiküllerin PCR üzerine etkisi hakkında literatüre katkı
sağlanacaktır. Ayrıca bu çalışma, bilgimiz dahilinde nanopartiküllerin fungal genomik DNA ile
etkileşiminin incelendiği ilk çalışmadır.