Kolorektal Adenokanser Olgularında Somatik KRAS Varyantlarının Retrospektif Değerlendirilmesi

Creative Commons License

Aydemir D., Kanjee M., Bulduk Z., Saruhan B., Yüce Kahraman Ç., Tatar A.

2. ulusal hematoonkogenetik kongresi, Girne, Kıbrıs (Kktc), 4 - 07 Mayıs 2023, ss.81

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Girne
  • Basıldığı Ülke: Kıbrıs (Kktc)
  • Sayfa Sayıları: ss.81
  • Atatürk Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Kolorektal kanser (KRK) dünyada en sık görülen üçüncü kanser türüdür ve kansere bağlı ölümlerin ikinci en yaygın nedenidir. KRK genellikle gen mutasyonları, epigenetik değişiklikler ve lokal enflamasyonu takiben on yıl içinde karsinoma dönüşen polip ile başlar. KRK’ların yaklaşık %90’ı histolojik olarak adenokanser tipindedir. KRAS geni, kromozom 12'nin kısa kolunda yer alan bir proto-onkogendir. RAS/MAPK sinyal yolağında yer alan ve hücresel farklılaşmayı, çoğalmayı ve büyümeyi kontrol eden Kras proteinini kodlar. KRAS geni mutasyonları, kolorektal kanserlerde en sık görülen sürücü mutasyonlardan biridir ve aynı zamanda prognostik bir biyobelirteçtir. Çalışmamızda Ocak 2021-Ocak 2023 tarihleri arasında Atatürk Üniversitesi Genetik Hastalıkları Değerlendirme Merkezi’ne (ATAGEN) başvuran 27 rektum, 76 kolon adenokanser tanılı 103 hasta örneği incelenmiştir. 86 tane formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE), 17 likit biyopsi örneği Yeni Nesil Dizileme (NGS) yöntemi ile analiz edilmiştir. NGS Qiagen GeneReader sistemi ile QIAact AIT DNA UMI Panel çalışılmıştır. Panel AKT1, ALK1, BRAF, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAQ, HRAS, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, NOTCH1, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, SMAD4, STK11 olmak üzere toplam 30 geni içermektedir. Çalışmamızda KRAS varyantları, AMP/ASCO/CAP kılavuzuna (Tier 1-4 sistemi) ve American College of Medical Genetics (ACMG) kriterlerine göre değerlendirilmiştir. Hastaların 44'ünde (%42,7) KRAS geninde patojenik/muhtemel patojenik varyant tespit edilmiştir. Bu hastalara Tier 1A ilaç önerisi sunulmuştur. Bu hastaların 21’inde KRAS genine ek başka bir gende patojenik/muhtemel patojenik varyant tespit edilmiştir. İkinci en sık saptanan varyantlar PIK3CA geninde tespit edilmiştir. KRAS geninde saptanan varyantların tamamı SNV olup, 1 hastada SNV’ye ek olarak gende amplifikasyon saptanmıştır. 26 hastada (%25,2) paneldeki geriye kalan genlerde patojenik/muhtemel patojenik varyant saptanmıştır. 33 hastada (%32) raporlanabilir bir varyant saptanmamıştır. KRK’da moleküler düzeydeki değişikliklerin saptanması, multidisipliner işbirliği ve hedefe yönelik tedavi ajanlarının kullanımı ile hastalar için en uygun tedavi yönetimini sağlayıp sağ kalımı arttıracaktır.