Alzheimer Hastalığı Tedavisi için GSK3β İnhibitörlerinin Sanal Tarama ile Tespit Edilmesi

Çelik A. C., Akıncı B., Babaoğlu Z. Y., Akkaya M., Kılıç D.

XXII.Kromatografi Kongresi, Erzurum, Türkiye, 11 - 13 Temmuz 2024, ss.94, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Erzurum
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.94
  • Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
  • Atatürk Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Alzheimer hastalığı, dünya çapındaki demans vakalarının %60-70'ine sebep olduğu

tahmin edilen, nörodejeneratif hastalıkları en yaygın halidir [1]. Hastalık, zihinsel yetenek

gelişimini bozan ve nörobilişsel işlevi kesintiye uğratan nörodejeneratif bir hastalıktır. Glikojen

sentaz kinaz 3 (GSK3), hücre farklılaşması, metabolizma, bağışıklık ve hücre canlılığı gibi

birçok ana biyolojik süreci düzenleyen, her yerde eksprese edilen, yüksek oranda korunmuş bir

serin/treonin kinazdır [2]. GSK3β’nın Alzheimer hastalığı için dikkat çekici şekilde hastalığı

modifiye edici hedef olmasına rağmen, Alzheimer hastalığı için klinik çalışmalarda etkili bir

GSK3β inhibitörü bulunmamaktadır. Bu nedenle GSK3β’nın yeni seçici ve güçlü

inhibitörlerinin keşfi, tasarlanması ve sentezleri araştırmacıların yeni hedefi olmaktadır. Bu

çalışmada ise ZINC veri tabanındaki moleküllerin içerisinden GSK3β potansiyel inhibitörlerin

hesaplamalı olarak belirlenmesi amaçlandı. Bu doğrultuda ZINC veri tabanındaki pirimidon

halkası içeren tüm moleküller indirildi ve LigPrep modülü ile hazırlanarak 2B yapılar 3B

koordinatlara dönüştürüldü; GSK3β kristal yapısı ise Protein Hazırlama Sihirbazı kullanılarak

hazırlandı. Glide doking algoritmaları ile sanal tarama yapıldı. Yapılan tarama sonucunda

GSK3β’nın potansiyel hedef inhibitörü olarak ZINC000019593080 ID’ye sahip bileşik

belirlendi [3].

Anahtar Kelimeler: Yapı Tabanlı Hesaplama, Alzheimer, GSK3β, İnhibitör

*Bu çalışma TÜBİTAK 2209-A Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme

Programı tarafından desteklenmiştir.

Kaynaklar

[1] F. Leng, P. Edison, Neuroinflammation and microglial activation in Alzheimer disease: where do we go from

here?, 2021, 17(3), 157-172.

[2] S. Srivastava, R. Ahmad, S.K. Khare, Alzheimer’s disease and its treatment by different approaches: A review,

2021, 216, 113320.

[3] Schrödinger Release 2021-4: Desmond Molecular Dynamics System, D. E. Shaw Research, New York, NY,

2021. Maestro-Desmond Interoperability Tools, Schrödinger, New York, NY, 2021.