Holstein Buzağılarda PİT-1 ve CSN3 Genleri Polimorfizmi ve Buzağı Doğum Ağırlığı Üzerine Etkileri
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Zootekni Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2021
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: İSMAİL FINDIK
Danışman: Memiş Özdemir
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Bu çalışmada, Gümüşhane'nin Kelkit ilçesinde özel bir işletme'de yetiştirilen Holstein ırkı buzağılara ait Pit-1 ve CSN3 genleri polimorfik yapılarının incelenmesi, genotip ve allel frekanslarının dağılımının belirlenmesi, tespit edilen polimorfik yapıların buzağılara ait doğum ağırlığı üzerine etkilerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmada kullanılan kan örnekleri 100 baş Holstein ırkı buzağılardan alınmıştır. Alınan kan örneklerinden izole edilmiş DNA'larda, PCR-RFLP yöntemi kullanılarak Pit-1 ve CSN3 genlerine ait Hinf1 polimorfizmleri tanımlanmıştır. PCR-RFLP ürünleri elektroforez ortamında yürütülerek sonuçlar ultraviyole (UV) cihazında bantlar halinde görüntülenmiştir. Araştırmada genotip, allel frekans dağılımları ve popülasyonun Hardy-Weinberg genetik denge testleri yapılmıştır. Pit-1/Hinf1 ve CSN3/Hinf1 polimorfik yapılarının buzağı doğum ağırlığı üzerine etkileri araştırıldı. Bulgular: Çalışılan popülasyonda Hardy-Weinberg genetik denge testine göre Pit-1 genine ait Hinf1 polimorfizmi genotip frekansları dağılımının dengede olduğu (P>0.05) ancak incelenen CSN3 gen polimorfizmi bakımından dengede olmadığı (P<0.05) gözlenmiştir. Popülasyondaki Pit-1 genine ait AA, AB ve BB genotip frekansları sırasıyla %13.4, %40.2 ve %46.3, A allelinin frekansı 0.34 ve B allelinin frekansı 0.66 olarak tespit edilmiştir. CSN3 genine ait AA, AB ve BB genotip frekansları sırasıyla %24.5, %36.7ve %38.8, A allelinin frekansı 0.43 ve B allelinin frekansı 0.57 olarak tespit edilmiştir. Yapılan ilişkilendirme analizlerinde hem Pit-1/Hinf1 hemde CSN3/Hinf1 polimorfizmine ait genotipler ile incelenen buzağı doğum ağırlığı arasında istatistiksel olarak önemli farklılıkların olmadığı görülmüştür. Sonuç: Holstein ırkı buzağılardan alınan kan örneklerinden PCR-RFLP yöntemi ile Hinf1 enzimi kullanılarak Pit-1 ve CSN3 genotipleri tespit edilmiştir. İncelenen Holstein buzağı popülasyonunda Pit-1 gen lokusu dağılımının Hardy-Weinberg prensibine göre genetik dengede olduğu, ancak CSN3 gen lokusu dapılımının dengede olmadığı görülmüştür. Pit-1 ve CSN3 gen polimorfizmi bakımından belirlenen genotip ve allel frekansları buzağı populasyonunun genotip çeşitliliğini ortaya koymada yeterli olduğu görülmüştür. Her iki polimorfik bölge genotipleri ile Buzağı doğum ağırlığı arasında istatistiksel olarak herhangi bir ilişki bulunamamıştır. Anahtar Kelimeler: Pit-1, CSN3, polimorfizm, PCR-RFLP, Holstein buzağı, Hinf1