Hematolojik malignitelerin yeni nesil dizileme yöntemi kullanılarak genetik olarak değerlendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SÜMEYYE ÖZTÜRK
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Melike Karaman
Eş Danışman: Çiğdem Yüce Kahraman
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Bu tez çalışmasında amacımız, hematolojik malignitelerde gözlenen belirli genlerdeki hotpoint mutasyonların (ASXL1, CALR, CBL, CEBPα, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SH2B3, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, ZRSR2) görülme sıklığı ve bu mutasyonların hastalık üzerine olan etkisini ortaya koymaktır. Yöntem: Çalışmada kullanılan araştırma materyali, 2018- 2022 yılları arasında Atatürk Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi'nde Tıbbi Genetik Bölümü'ne başvuran hematolojik malignite öntanısı veya tanısı olan hastalardan alınan hemogram kanlarından izole edilen DNA'lardı. Çalışma methodu planlamsına göre hastalardan alınan kandan DNA izolasyonu QIAamp DNA Blood Mini QIAcube Kit (QIAGEN, Germany) kullanıldı. İzole edilen DNA kalitesi Qubit Florometre (Invitrogen) cihazında ölçüldü. PCR ve kütüphane oluşturma basamakları QIAact Myeloid DNA UMI Panel (QIAGEN, Germany) üreticinin talimatları doğrultusunda gerçekleştirildi. Oluşan PCR ürünlerinin sekanslanması GeneReader NGS cihazında gerçekleştirilecek olup, data analizi QIAGEN Clinical Insight platformunda yapıldı. Bulgular: Erzurum ve çevresinden gelen, hematolojik malignite tanısı veya ön tanısına sahip hastaların yeni nesil dizileme yöntemiyle tespit edilen myeloid panelde, görülen mutasyonlar incelenmiştir. Gözlenen mutasyonlar, tanı, cinsiyet ve yaş dağılımları açısından incelendiğinde erkek hastalarda ve ileri yaşlarda bu hastalığa ait mutasyonların daha sık görüldüğü tespit edilmiştir. Sonuç: Bulgular, hasta sayısının arttırılması ve hematolojik maligniteye neden olan genlerin daha detaylı araştırılmasıyla bu maligniteye sahip hastaların daha hızlı tanı almasına ve mutasyonlara özgü bireysel tedavi açısından takip altında olmasına fayda sağlayacağını göstermiştir. Anahtar Kelimeler: Hematolojik malignite, myeloproliferatif hastalık, Yeni nesil dizileme, sekans analizi