Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Diş Hekimliğinde Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Diş Hekimliği Fakültesi, Klinik Bilimler, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2021
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ERCAN ERGÜN
Danışman: Turgut Demir
Özet:
Periodontal Apse Örneklerinin Bakteriyel İçeriğinin Real Time PCR ile
Kantitatif Olarak Araştırılması
Amaç: Bu çalışmanın amacı, daha önce kültür yardımıyla periodontal apselerden
ilk kez tespit edilen bakterilerin yanı sıra, periodontal apse oluşmasının nedeni olarak
kabul edilmiş olan periodontitis etkeni bakteriler ve son dönemde periodontal hastalık
etkeni olabileceği ileri sürülen yeni bakteri türlerinin periodontal apse örneklerinde total
bakteriler arasındaki mevcudiyeti ve yoğunluğunun Real Time PCR ile kantitatif olarak
belirlenmesidir.
Materyal ve Metot: Sistemik olarak sağlıklı, son üç ay içerisinde antibiyotik ve
antienflamatuvar ilaç kullanmamış, klinik ve radyolojik muayene sonucu endodontik
problemi olmayıp periodontal apse teşhisi konulan 30 gönüllü hastadan peridontal apse
içeriği alındı. Toplanan Periodontal Apse örneklerinden genomik DNA izolasyonu için
Genomic DNA Purification sistemi kullanılarak üretici firmanın protokolüne göre
yapıldı. Periodontal apse örneklerinde araştırdığımız bakterilerin kantitatif miktarının
belirlenmesi amacıyla SYBR Green Real Time PCR (qPCR) yöntemi kullanıldı. İzole
edilen genomik DNA’nın konsantrasyonu ve saflık derecesi nanodrop cihazı kullanılarak
spektroskopik olarak belirlendi. Periodontal apse içerisindeki bakterilerin nispi ölçümü
için Real-Time PCR hassas, etkili ve güvenilebilir bir yöntemdir. Sunulan çalışmada
toplam bakteri yükü içerisindeki hedef bakteri prevalansını ölçmek için oluşturulan
standart eğri için Escherichia coli jm 109 suşu kullanıldı. İlk olarak 108 den 101 e kadar
değişen sayılarda Escherichia coli hücrelerinden izole edilecek genomik DNA’lar
kullanılarak SYBR Green Real Time PCR yöntemiyle her bir genomik DNA için CT (eşik
döngüsü) değeri hesaplanarak standart grafik oluşturuldu. Daha sonra 30 gönüllü
bireyden toplanan periodontal apse örneklerlerinden elde edilen genomik DNA
kullanılarak her bir bakteri ve total bakteri (16S rRNA) için qPCR yapıldı. Elde edilen
CT değerleri standart grafiğe yerleştirilerek total bakteri içindeki araştırılan bakterinin
sayısı belirlendi.
Bulgular: Araştırdığımız 21 bakteriden 17’sinin periodontal apse içeriğindeki
varlığı, tespit sıklığı ve miktarları belirlendi. A.actinomycetemcomitans, S.pneumoniae,
S.haemolyticus ve M.cerebrosus incelediğimiz örneklerde tespit edilemedi.
P.gingivalis’in periodontal apse içeriğinde en yüksek rölatif bakteri sayısına sahip olan
bakteri olduğu saptandı. Yeni çalışmalarda periodontal hastalıklarda etkili olan bakteriler
olan D.pneumosintes, P.endodontalis ve F.alocis yüksek prevalans ve sayılarda tespit
edildi. Diğer taraftan kültür yöntemiyle yakın zamanda ilk kez saptanmış olan bakteriler
olan S.mitis, S.gordonii, S.constellatus, A.naeslundii ve bunun yanında P.acnes’in
prevalans ve rölatif bakteri sayısı değerleri belirlendi.
Sonuç: Periodontal patojen oldukları bilinen bakterilerin, son zamanlarda yapılan
çalışmalarda periodontal hastalıklarda etkili oldukları düşünülen bakterilerin, yakın
zamanda kültür yöntemiyle periodontal apse içeriğinde ilk kez bulunduğu belirtilen ve
farklı vücut bölgelerinde apse gelişiminde etkili olduğu bilinen bakterilerin periodontal
apse içeriğindeki varlık, prevalans ve sayıları belirlendi.