Fermente Türk sucuğundan izole edilen laktik asit bakterilerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle karakterizasyonu
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Veteriner Anabilim Dalları Bilimsel Hazırlık Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2008
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: GÜLŞAH ADIGÜZEL
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Mustafa ATASEVER
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Araştırmada, piyasadan temin edilen 15 adet fermente sucuk örneğinden izole edilen laktik asit bakterilerinin morfolojik, biyokimyasal, fizyolojik ve fenotipik yöntemlerle analizleri yapılmış ve elde edilen veriler 16S-23S rRNA PCR, BOX PCR metodları ile desteklenerek mikroorganizmaların karakterizayonu gerçekleştirilmiştir.Araştırma sonucunda, MIS yönteminin laktik asit bakterilerinin tanımlanmasında yüzde olarak düşük tanı sonucu verdiği görülmüş ve elde edilen sonuçlar bir metabolik profilleme yöntemi olan API ile desteklenmeye çalışılmıştır. API verilerine göre 10 izolat Lactobacillus plantarum, 8 izolat Pediococcus pentosaceus, 6 izolat Lactococcus lactis subsp. lactis, 5 izolat L. curvatus subsp. curvatus, 5 izolat L. brevis, 3 izolat L. fermentum, 3 izolat Weisella viridescens, 2 izolat L. delbrueckii subsp. delbrueckii, 2 izolat W. confusa, 1 izolat L. collinoides ve 1 izolat ise Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides/ dextranicum olarak tanımlanmıştır. Bu sonuçlara göre sucukta baskın florayı Lactobacillus türlerinin oluşturduğu ve dominant türünde L. plantarum olduğu tespit edilmiştir.Elde edilen bu sonuçların genotipik verilerle desteklenip desteklenmediği araştırılmıştır. rRNA PCR yönteminin izolatlar arasındaki ayrım açısından yetersiz olduğu, BOX-PCR yönteminin ise bu ayrımı başarılı bir şekilde ortaya koyduğu belirlenmiştir. BOX PCR sonuçlarıyla API verileri mukayese edildiğinde API'ye göre, Pediococcus pentosaceus olarak isimlendirilen 41 nolu izolatın cluster analiz verileri incelendiğinde Lactococcus lactis subsp. lactis türüne ait, Weisella viridescens olarak isimlendirelen 4 kod numaralı izolatın ise BOX-PCR verileri dikkate alınarak hazırlanan cluster analiz sonuçları incelendiğinde aslında Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides/ dextranicum türüne ait bir izolat olduğu tespit edilmiştir.Elde edilen tüm sonuçlar bir araya getirildiğinde klasik yöntemlerin fenotipik yöntemlerle, fenotipik yöntemlerin ise mutlaka genotipik yöntemlerle desteklenmesi gerektiği sonucuna varılmıştır.