Periodontal Apselerden Kültür Yardımıyla İzole Edilen Bakterilerin 16s Pcr Ve Dna Dizi Analizi İle Tanılanması
Tezin Türü: Diş Hekimliğinde Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Diş Hekimliği Fakültesi, Klinik Bilimler, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2017
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Kübra KARAÇAM
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Turgut DEMİR
Özet:Amaç: Gelişen teknoloji doğrultusunda periodontitis için yeni muhtemel patojenlerin ortaya konduğu bir dönemde, kültüre edilebilen fakat patojen olarak henüz sınıflandırılmamış bakterilerin periodontal apse için etken olmasını beklememek için bir neden yoktur. Periodontal apse mikrobiyolojisi üzerine günümüze kadar yapılan çalışmaların çoğu iyi tanınan bakteri türleri üzerinde yapılmış, hastalığa etken olabilecek bilinmeyen farklı bakteriler üzerine çalışma yapılmamıştır. Bu çalışmada periodontal apse örneklerindeki kültüre edilebilen aerob, fakültatif anaerob bakterilerden besiyerinde en yoğun olarak gelişen koloni örnekleri izole edilip, moleküler yöntemler ile tanımlanması hedeflenmiştir. Materyal ve Metot: Sistemik olarak sağlıklı, son 4 hafta içinde herhangi bir antibiyotik kullanmamış, periodontal apse teşhisi konulmuş 20 gönülllü hastadan periodontal apse örnekleri alındıktan sonra örnekler bekletilmeden mikrobiyoloji laboratuvarına götürülerek kültüre edildi. 2.günün sonunda sayısal olarak fazla olan koloniler saflaştırılarak diğer karakterizasyon işlemlerine kadar %16'lik gliserol içeren NB (Nutrient Broth) içerisinde -86 oC'de saklandı. Daha sonra genomik DNA'nın izolasyonu yapıldı. Her bir izolattan saflaştırılan genomik DNA'dan, 16S rRNA genleri PCR yardımı ile çoğaltıldı. Elde edilen PCR ürünleri jel görüntüleme sistemi ile görüntülendikten sonra hizmet alımı yoluyla DNA dizi analizleri yapıldı. Analizler sonucu düzenlenen nükleotid dizileri NCBI kütüphaneleri (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/blast.cgi) ile homolojilerinin belirlenmesi için BLAST işlemi yapıldı. Sonuç olarak değerlendirmelerin sonunda gen dizileri GenBank'a girilerek kabul numaraları alındı. Bulgular: 20 periodontal apse örneğinden 60 bakteri izole edilerek tanılandı. 33 örnekte Streptococcus türleri (S. pneumoniae, S. mitis, S.gordonii, S.anginosus, S. sanguinis, S. massiliensis, Streptococcus spp., S.cristatus, S.sinensis, S.mutans) 7 örnekte Neisseria türleri ( N. Sicca, N.elongata, N.subflava), 4 örnekte Actinomyces türleri (A. naeslundii, A. odontolyticus), 3 örnekte Staphylococcus türleri, (S.haemolytıcus, S. equorum, Staphylococcus spp.), 2 örnekte Morococcus cerebrosus ve birer örnekte Moraxella spp., Bacillus spp., Enterococcus casseliflavus türleri tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda tespit edilen bakteri türleri vücudun farklı bölgelerinde apse ve ciddi enfeksiyonlara neden olan bakteriler oldukları ve yine bu bakteri türlerinin çoğunun periodontal apselerde ilk kez izole edilen türler oldukları literatür taramasında ortaya kondu. Periodontal apse içeriğinden alınan ve aerobik ve fakültatif anaerobik ortamda yoğun üreme gösteren bu bakteriler apse mikrobiyotasına yönelik ileri çalışmalara ihtiyaç duyulduğunu ortaya koymaktadır.