Doğu Anadolu Bölgesinde bulunan su kaynaklarından soğuğa adapte olmuş bakterilerin izolasyonu, moleküler karakterizasyonu ve enzim üretme potansiyellerinin araştırılması
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SELMAN MUSLU
Danışman: Ahmet Adıgüzel
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada Erzurum ve Van çevrelerinden toplanan su örneklerinden psikrofilik veya psikrotolerant özellik gösteren toplam 60 bakteri izole edildi. rep-PCR ve 16S rRNA analizleri sonucu farklı olduğu tespit edilen Pseudomonas, Psychrobacter, Rahnella, Shewanella, Flavobacterium, Exiguobacterium, Glutamicibacter cinslerine ait 9 örneğin konvensiyonel ve moleküler karakterizasyona devam edildi. Psikrofilik özellik gösteren izolatların pH, tuz ve sıcaklık ihtiyaçları için testler yapıldı. İzolasyonu yapılan örneklerin, SM0112E hariç diğerlerinin %2-10 aralığında tuz konsantrasyonlarında büyüyebildiği gözlemlendi. İzolatların tümünün gelişebildikleri en uygun pH aralığı 5-7 olarak belirlenirken SM0112E hariç tüm izolatların 25-30 °C aralığında da gelişim gösterebildikleri gözlemlendi. İlginç bir şekilde SM012D suşunun %15 tuz yoğunluğunda gelişim gösterebildiği, SM018A suşunun ise 4-30 °C gibi geniş bir sıcaklık ve pH: 4-9 gibi geniş bir pH aralığında gelişim gösterdiği tespit edildi. Tüm test izolatlarının 16S rRNA sekans analizleri gerçekleştirildi. Bu analizler sonucunda 16S rRNA dizileme ve biyoinformatik çalışmaları sonrasında bakterilerin; SM011A: Pseudomonas chlororaphis subsp. aureofaciens'e %99,93; SM012D: Psychrobacter faecalis'e %99,42; SM015A: Rahnella aquatilis'e %99,21; SM018A: Shewanella putrefaciens'e %99,86; SM018F: Pseudomonas putida'ya %99,93; SM0110A: Pseudomonas lactis'e %99,28; SM0112E: Flavobacterium chryseum'a %98,33; SM0117A: Exiguobacterium mexicanum'a %99,86 ve SM0118A: Glutamicibacter arilaitensis'e %98,69 oranında benzerlik gösterdiği tespit edildi. Elde edilen izolatlar proteaz, lipaz, amilaz ve selülaz enzimleri açısından değerlendirildi. SM011A ve SM0110A olarak kodlanan izolatların güçlü multi enzim aktivitesi gösterdiği ve hiçbir izolatın selülaz enzimi üretemediği saptanmıştır.