Sığırlarda verim özelliklerini etkileyen bazı moleküler markır polimorfizmlerinin belirlenmesi ve verimle ilişkilendirilmesi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Zootekni Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2017
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ZEYNEP SÖNMEZ
Danışman: Memiş Özdemir
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Sığırlarda verim özelliklerini etkileyen ELF5 (E74-Like Faktör 5; Epitel-Spesifik ETS Faktör 5), BMP2 (Bone Morphogenetic Protein2; Kemik mineral yoğunluk proteini 2) ve FGF21 (Fibroblast Growth Factor 21; Fibroblast Büyüme Faktör 21) genlerin moleküler markır polimorfizmlerini belirlemek amacıyla yapmış olduğumuz çalışmada Esmer sığırlara ait DNA örnekleri kullanılmıştır. Farklı bölgelere ayrılmış her bir gen için PCR analizleri uygulanmış, sonrasında Yüksek Çözünürlüklü Erime Analizi (HRM) yöntemi ile örnekler kümelere ayrılmıştır. Her kümeden örnekler rastgele seçilerek sekans analizleri uygulanmış ve polimorfik bölgeler tespit edilmiştir. ELF5, FGF21 ve BMP2 gen bölgeleri DNA dizi analizleri sonucu; ELF5 geni 2. intron bölgesi için g.65825359 C/T, g.65825499 G/A transisyonları ve g.65825371 A delesyonu tespit edilmiş, ELF5 geni 5. ekzon bölgesi için g.65825909 T/C, g.65826062 G/A, g.65826123 A/C, g.65826134 C/T ve g. 65826138 T/C olmak üzere 5 farklı polimorfik bölge tanımlanmış, FGF21 geni 1. ekzon bölgesi için g.55834828 C/G polimorfik bölgesi ve FGF21 3. ekzon bölgesi için g.55836088 G/T ve g.55836007. C/A polimorfizmleri belirlenmiş, BMP2 geni 2. ekzon bölgesinde g.49551963 T/C polimorfizmi ve BMP2 geni 3. ekzon bölgesi için g.49551337 G/A, g.49551405 G/T, g.49551428 G/C, g.49551433 A/C ve g.49551449 T/G polimorfik bölgeleri tanımlanmıştır. ELF5 geninin 2. intron bölgesi için tanımlanmış polimorfik bölgeleriden g.65825371 -/A polimorfik bölgesi ile gerçek süt verimi (laktasyon süt verimi) ve pik süt verimi arasında, g.65825359 C/T polimorfizmi ile pik gün verim değerleri arasında istatistiksel olarak anlamlı ilişkiler olduğu tespit edilmiştir (P 0.05). Ancak, hayvan ıslahı alanında yapılacak farklı çalışmalarda, belirlenen polimorfik bölgelerin markır olabilme özelliklerinin araştırılması önerilmektedir. Anahtar Kelimeler: ELF5, BMP2 ve FGF21, HRMA, polimorfizm, süt verimi