Karbapenem dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında sınıf D beta laktamaz varlığının genotipik yöntemle araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: İCLAL AĞAN
Danışman: Ülkü ALTOPARLAK
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Acinetobacter baumannii tüm dünyada hastane kaynaklı enfeksiyonların en önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Özellikle son yıllarda çoklu ilaç direncine sahip gram negatif bakterilerin tedavisinde son çare olarak kullanılan karbapenemlere giderek artan direnç, Acinetobacter baumannii'ye bağlı enfeksiyonların tedavisini de oldukça zorlaştırmıştır. Bu tür enfeksiyonlarda altta yatan genetik direnç mekanizmalarının tespiti, özellikle yoğun bakım ünitesinde nozokomiyal enfeksiyonların kontrolü ve önlenmesi için uygun önlemlerin alınmasına yardımcı olabilir. Çalışmamızın amacı, A. baumannii karbapenem direncinden sorumlu OXA tipi karbapenemazları tespit edip hem hastanemiz hem de ilimiz için epidemiyolojik veri oluşturmak ve enfeksiyon kontrol önlemlerinin planlanmasına katkı sağlamaktır. Yöntem: Ocak 2018- Eylül 2018 tarihleri arasında Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde çeşitli kliniklerde yatarak tedavi gören hastalardan izole edilen 78 A. baumannii izolatı konvansiyonel metodlar ve otomatize sistemle [BD Phoenix (Becton Dickinson, ABD) ve Vitek-2 (bioMerieux, ABD)] tanımlandı. İzolatların antimikrobiyal duyarlılıkları otomatize sistem, Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve Broth mikrodilüsyon yöntemiyle çalışıldı. Her üç yöntemde de karbapeneme dirençli bulunan izolatlarda DNA ekstaksiyonu sonrası konvansiyonel PCR ile blaOXA-23-like, blaOXA-24/40-like, blaOXA51-like, blaOXA-58-like ve blaOXA-143-like gen bölgeleri araştırıldı. Pozitif bulunan gen bölgeleri çift yön sekanslama ile doğrulandı. Bulgular: Çalışmaya dâhil edilen izolatların tamamı siprofloksasin, imipenem ve meropeneme dirençli bulunmuştur. İn-vitro en etkin antibiyotik kolistin ikinci sırada ise trimetoprim-sulfametoksazol olarak tespit edilmiştir. İzolatların %98.7'sinde (77) blaOXA-23-like ve %98.7'sinde (77) blaOXA-51-like gen bölgeleri pozitif bulunmuştur. İzolatların %97.4'ünde (76) hem blaOXA-23-like hem de blaOXA-51-like pozitif tespit edilmiştir. Test edilen izolatların hiçbirinde blaOXA-24/40-like, blaOXA-58-like blaOXA-143-like gen bölgeleri tespit edilememiştir. Sonuç: Karbapenem direncine neden olan gen bölgesinin aktarılabilir veya yapısal olduğunun tespit edilmesi ilerde olabilecek salgınların önüne geçmek için önemlidir. Bizim hastanemizde A. baumannii izolatlarında sınıf D beta-laktamazlardan plazmidle aktarılabilir bir gen bölgesi olan blaOXA-23-like baskın olarak tespit edilmiştir. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, karbapenem direnci, sınıf D betalaktamaz