Laringeal skuamöz hücreli karsinomlu hastalarda ceRNA düzenleyici yolakta bulunan UCA1/miR138/CDK6 ekspresyon seviyelerinin değerlendirilmesi
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Neslihan CİNKARA
Danışman: Çiğdem Yüce Kahraman
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Noncoding RNA'lar (ncRNA'lar) birçok kanser türünde nüks ve prognozu öngörmek için biyolojik belirteç ve terapötik hedef olabilme potansiyeline sahiptir. Son yıllarda yapılan çalışmalarda, çeşitli kanserlerde lncRNA ‐ miRNA ‐ mRNA ceRNA (Kompetitif endojen RNA) ilişkisi ortaya çıkarılmıştır. Bu çalışmanın amacı, LSCC (Laringeal Skuamöz Hücreli Karsinom) ve komşu normal doku örnekleri arasında UCA1/miR-138/CDK6 ceRNA düzenleyici ağda ekspresyon seviyelerini ve birbirleriyle olan ilişkilerini araştırmaktır. Aynı zamanda LSCC'de ceRNA düzenleyici ağda lncRNA'ların hedef genleri nasıl düzenlediğini araştırmaktır. Ayrıca çalışmamızla, ncRNA'ların terapötik hedefler ve prognostik biyobelirteç olma potansiyeli düşünüldüğünde, ilerde bu alanda yapılacak çalışmalara katkı sunacak bilgiler elde etmeyi amaçlamaktayız. Yöntem: KBB (Kulak-Burun-Boğaz) kliniğinde klinik olarak LSCC tanısı alarak, opere edilen hastaların laringeal doku örneklerinde çalışılacaktır. Çalışmada hastaların ameliyat sırasında çıkarılan dokularından, kanserli doku örnekleri ve kontrol olarak da normal komşu doku örneklerinden total RNA izolasyonu yapılacaktır. Kantitatif real-time PCR yöntemi ile UCA1, miR-138 ve CDK6 ekspresyon düzeyleri belirlenecektir. Hasta ve kontrol dokulardaki ekspresyon düzeyi kıyaslanacak ve istatistiki analiz yapılacaktır. Bulgular: Kanserli doku örnekleri ve kontrol olarak da normal komşu doku örneklerinin ekspresyonları kıyaslanmıştır. Kanserli dokularda CDK6 düzeylerinde artma daha önce yapılan çalışmaları destekler niteliktedir ama istatistiki olarak anlamlı bulunamamıştır. UCA1 ve miR-138 düzeylerinde değişiklik literatürle benzerdi fakat kontrol grubuyla kıyaslandığında anlamlı bir farklılık bulunamamıştır. Tartışma ve Sonuç: Aşırı eksprese edilen metastazı teşvik eden ncRNA'lar, terapötik müdahale için olası hedeflerdir. Bu alanda, daha birçok çalışmaya ve in vivo karakterizasyona ihtiyaç vardır. Bu çalışmalar ncRNA'ların gelişim, hastalık ve diğer hücresel süreçlerdeki rolleri ve işlevlerini ortaya koyacaktır. Sonuçta, protein kodlayan genler ve miRNA'lar gibi, lncRNA'lar da kanserde biyolojik belirteç olarak kullanılabilir ve hatta yakın gelecekte kemoterapötik ilaç geliştirme alanının hedefi haline gelebileceklerdir. LSCC'nin moleküler mekanizmasını anlamak adına UCA1/miR-138/CDK6 ekseninin LSCC dokusunda yapılan ilk çalışmasıdır. Çalışmamızda, daha önce bildirilen raporlarla UCA1-miR-138-CDK6'nın ekspresyon seviyeleri uyumluydu fakat istatiksel olarak anlamlı bulunamadı. Bu çalışma, LSCC hücre dizilerinde yapılmamıştır. Mevcut bulguları destekleyecek hayvan deneylerinden ve ileriye dönük klinik çalışmalarıdan yoksundur. Bu nedenle, bu sinyal yolunun işlevini hayvanlarda olduğu kadar çoklu LSCC hücre dizilerinde daha fazla doğrulamak için gelecekte daha fazla çalışmalar yapılmalıdır.