Fare genomunda bulunan bazı glikoliz yolu genlerinin cDNA``larının üretilmesi, antisens mRNA üretimi ve İn Situ hibridizasyon ile gen ekspresyon analizi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Fakültesi, Kimya, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2004
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MURAT ÇANKAYA
Danışman: Hasan Özdemir
Özet:ÖZET Yüksek Lisans Tezi FARE GENOMUNDA BULUNAN BAZI GLİKOLİZ YOLU GENLERİNİN cDNA'LARININ ÜRETİLMESİ, ANTİSENS mRNA ÜRETİMİ ve İN SİTU HİBRİDİZASYONU İLE GEN EKSPRES YON ANALİZİ Murat ÇANKAYA Atatürk Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Kimya Anabilim Dalı Danışman: Doç. Dr. Hasan ÖZDEMİR Hayvan genomları, 15.000 (Drosophila) ve 30.000 (insan, fare) arasında gen ihtiva ederler. Bu genlerin büyük çoğunluğunun sekanslarının bulunması, biyolojik regülasyonun temelini teşkil eden kompleks genetik ve protein etkileşmelerini araştırma imkanlarına neden olmuştur. Birçok bileşen ihtiva eden düzenleyici metabolik ağın anlaşılması için, her bir komponentin ekspresyon zamanının ayrıntılı bir şekilde bilinmesi önemli bir avantaj sağlar. Gen ekspresyon örnekleri, RNA in situ hibridizasyonu ile kolaylıkla belirlenebilir. Değişik dokularda gen ekspresyon örneklerinin tayini ve gösterilmesine izin veren tamamen otomatik olarak düzenlenmiş sistemler vardır. Ayrıca RNA in situ hibridizasyonu vasıtasıyla elde edilen gen ekspresyon verilerinin otomotik mikroskopik taranması için bilgisayar programı oluşturulmuştur. Bu çalışmada glikoliz yolunda bulununan bazı enzim genleri (Gck, Hk2, Pfkm, Aldo 1, Aldo2, Aldo3, Tpi, Gapds, Pgaml, Eno2, Eno3, Pklr, Pkm2) seçildi. Bu enzimler için spesifik primerler düzenlendi. Bu spesifik primerler kullanılarak spesifik cDNA kalıpları hazırlandı. cDNA kalıpları ile antisens mRNA'lar (in vitro transkripsiyon) üretildi. Bu antisens mRNA'ların;14,5 günlük fare embriyosu kullanılarak in situ hibridizasyon yapıldı. Ekspresyon sonuçları mikroskopta incelenerek internet ortamına aktarıldı. 2004, 81 sayfa Anahtar kelimeler: İn situ hibridizasyon, mRNA, cDNA, gen ekspresyonu