Lokal olarak izole edilen bakterilerle ekstraselülerpolisakkarit üretimi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: YAPRAK İLAYDA KARADAYİ

Danışman: Ahmet Adıgüzel

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

EPS'ler hücreyi olumsuz dış etkilerden korumak, antibakteriyel, ağır metaller ve toksik bileşikler gibi tehlikeli çevresel faktörlere karşı savunmada kullanılmaktadır. Farklı fiziksel, kimyasal ve reolojik özellikleri sayesinde gıda, ilaç, kozmetik, petrol ve tekstil gibi birçok alanda kullanıldığı için büyük önem arz etmektedir. Bu doğrultuda EPS üretimi için ucuz substrat olarak nitelendirilen şeker fabrikası yan ürünü olan melas kullanılmıştır. Mikrobiyal EPS üretimi için Erzurum bölgesinde ki (Ilıca, Pasinler, Köprüköy) termal kaplıcalarından alınan su örneklerinden, toplam 28 termofilik bakterinin izolasyonu gerçekleştirilmiş ve bu bakterilerin herbirinin EPS üretim kapasitesi araştırılmıştır. En yüksek EPS üretimi YK-25 izolatı ile 3,2 g/l şeklinde belirlenmiştir. Bu izolatın tanısı için, 16S rRNA dizi analizi yapılmış ve %99 oranında Anoxybacillus gonensis suşuna benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir. Daha sonra A. gonensis YK-25 bakterisi EPS üretim verimini artırabilmek için kültür parametrelerinin (pH, sıcaklık, pepton, inkübasyon süresi ve melas konsantrasyonu) optimizasyonu yapılmıştır. Beklenen optimal değerler pH 7, sıcaklık 55°C, melas konsantrasyonu 100 ml/l, pepton konsantrasyonu 6 g/l, inkübasyon süresi ise 96 saat olarak bulunmuştur. Bu optimal değerlerle gerçekleştirilen deneyler sonucunda; 3,2 g/l EPS miktarı 4,4 g/l'ye yükselmiştir. Bu EPS'nin karakterizasyon çalışmaları yapılmış ve moleküler ağırlığı 102 kDa olarak gözlemlenmiştir. Ayrıca EPS'nin konsantrasyonuna bağlı olarak, SHSY-5Y, Caco-2, HT-29, A-549 ve DU-145 kanser hücre hatlarında antikarsinojen etki gösterdiği tespit edilmiştir.