Üst gastrointestinal sistem yakınmalı hastalarda moleküler ve kültür yöntemleriyle Halicobacter pylori araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2004
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: HAMİDULLAH UYANIK
Danışman: Osman AKTAŞ
Özet:ÖZET Helicobacter pylori gastrit, gastroduodenal ülser, gastrik adenokarsinom, gastrik mukozayla ilişkili lenfoid doku lenfoması gibi önemli üst gastrointestinal bölge hastalıklarına neden olabilen bir bakteridir. Bu çalışma, üst gastrointestinal yakınması olan olguların endoskopi ile alınan mide biyopsi (MB) örneklerinde kültür, Gram boyama ve PCR, dışkı örneklerinde ise PCR yöntemiyle H. pylori varlığının araştırılması ve kullanılan yöntemlerden elde edilen sonuçların karşılaştırılması amacıyla planlanmıştır. Çalışmaya, en az bir hafta öncesine kadar antibiyotik ve antiasit almamış 36 olgu dahil edilmiştir. Hastaların antrum bölgesinden 2 biyopsi örneği alınmış, örneklerden birisi kültür ve Gram boyama için diğeri de PCR çalışmalarında kullanılmıştır. H. pylori izolasyonunda % 5 koyun kanlı Brucella (Biolab®, BAB20500) agar besiyerleri kullanılmıştır. Biyopsi örneklerinden H. pylori DNA eldesi amacıyla "NucleoSpine Genomic DNA" ve dışkı örneklerinden H. pylori DNA eldesi için de "Invisorb® Spin Stool DNA kit (İnvitek)" kullanılmıştır. DNA örneklerinde PCR, "Applied Biosystem 5700 Real Time PCR" cihazı kullanılarak yapılmıştır. Uygulanan yöntemlerin duyarlılık ve özgüllükleri, biyopsi kültür sonuçlarına göre "Receiver Operating Characteristic (ROC)" eğrisi kullanılarak hesaplanmıştır. Olguların 31 (% 86.1)'inde yapılan testlerin en az birinden pozitif sonuç alınırken 5 (% 13.9) olguda tüm testlerden negatif sonuç alınmıştır. Buna göre erkeklerin 17 (% 85.0)'i ve kadınların ise 14 (% 87.5)'ü H. pylori yönünden pozitif bulunmuştur. Kadın ve erkeklerde H. pylori pozitifliği arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmemiştir. H. pylori varlığı tespit edilen 31 olgunun 16 (% 51.6)'sında yapılan tüm testlerden pozitif sonuç alınmıştır. MB kültürlerinde 25 (% 69.4) örnekte H. pylori izole edilmiş, MB PCR ile 26 (% 72.2), Gram boyama ile 26 (% 72.2) ve Gaita PCR ile 20 (% 55.6) olguda H. pylori pozitifliği saptanmıştır. MB PCR'nin duyarlılığı % 92.0, özgüllüğü % 72.7, Gaita PCR testinin duyarlılığı % 68.0, özgüllüğü ise % 72.7 ve MB'den direkt olarak yapılan Gram boyama'nın duyarlılığı % 88.0, özgüllüğü % 63.6 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, biyopsi kültür sonuçları referans olarak alındığında MB PCR diğer testlerden daha duyarlı olarak bulunmuştur. Daha kolay uygulanabilen, çabuk sonuç veren ve diğerlerine göre maliyeti çok daha ucuz olan ve duyarlılığı MB PCR'ye yakın bulunan Gram boyama yönteminin, endoskopik bulgularla birlikte değerlendirildiğinde H. pylori tanısında tercih edilebileceği kanısına varılmıştır. Anahtar Kelimeler: Helicobacter pylori, PCR, mide biyopsisi, dışkı