Candida Türlerinin Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2016
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: Emrullah Aksakal
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Özlem BARIŞ
Özet:Bu çalışmada Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına ait kültür koleksiyonundan alınan Candida türleri kullanılmıştır. Alınan 60 adet Candida izolatlarının tanı ve karakterizasyonu; konvensiyonel (morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal testler) ve moleküler yöntemlerle yapılmış olup tür düzeyinde tanılanmıştır. Spesifik primerler yardımıyla RAPD - PCR moleküler tiplendirme metodları kullanılarak 60 Candida türünün akrabalık dereceleri belirlenmiştir. Bu amaçla yapılan çalışmada dört farklı DNA izolasyon tekniği denenerek Candida türleri için en uygun DNA izolasyon metodu belirlenmiştir. İzolasyonu yapılan ve RAPD – PCR yöntemi ile tiplendirilmeye çalışılan Candida'ların istatistiki olarak değerlendirmeleri yapılmış ve C. albicans'ın merkezde %35, ve tüm dendogramda %57 oranında dağılım gösterdiği ve tüm Candida'lar içinde merkezi konumda yer aldığı belirlenmiştir. Bununla birlikte tüm Candida'lara oranla %3,3 oranında C. guilliermondii, %5 oranında ise C. pseudotropicalis, C. albicans'lara yakın özellikler göstererek C. albicans grupları içinde yer almışlardır. Ayrıca %3,3oranında C. geotrichum, hem C. glabrataya hemde C. tropicalis'e 1. Derece, C. albicans'lara ise 2. derece yakın akrabalık göstermiştir. C. glabrata'ya ait iki farklı grup, zıt kutuplarda yer alarak C. albicans'lara akrabalık derecelikleri bakımından uzak yerleşim göstermişlerdir. C. krusei türleri'de %3,3 ve %5 oranlarında iki farklı grup olarak zıt kutuplarda ve C. albicans'lara akrabalık yönünden yakın derecede yer almışlardır. C. parapisilosis türlerinin çalışmada kullanılan tüm Candida'lara oranı %8 olup, en uzak akraba olduğu saptanmıştır. Aynı türlerin farklı gruplarda yer alan bireyleri için farklı suşlar olabileceği değerlendirmesi yapılmıştır.